LIVIA — 教程

每个 LIVIA 工具的可视化分步指南

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通过实例学习 LIVIA

以下每个教程都通过自动播放的截图展示真实工作流程。点击任意步骤跳转，或让其自动播放。准备好亲自尝试了吗？点击 试一试 按钮。

预测分析

从任意平台上传预测文件并分析界面置信度

试一试 →
1
上传预测文件或选择示例文件
2
查看置信度指标 — iLIS, ipSAE, ipTM（每个模型）
3
探索所有模型的 PAE、LIS 和 cLIS 热力图
4
序列查看器 — 高亮显示相互作用残基
5
线性接触图 — Cβ ≤ 8 Å 的 cLIR 残基对
6
在 Mol* 查看器中查看 3D 结构
7
调整可视化的颜色预设
8
链内逐残基 LIS 和 pLDDT 图表
教程步骤
上传预测文件或选择 p53–MDM2 示例文件

AFDB 和 FlyPredictome 书签工具

一键从 AlphaFold DB 或 FlyPredictome 跳转到 LIVIA

安装 →
1
将 在 LIVIA 中打开 按钮拖到浏览器书签栏（一次性安装）
2
打开任意 AlphaFold DB 二聚体条目页面
3
点击书签 — LIVIA 二聚体页面在新标签页中打开，指标自动加载
4
二聚体的交互式 3D 结构（Mol* 查看器）
5
同样适用于 FlyPredictome — 访问 famdb_details 页面并点击书签
6
LIVIA FlyPredictome 打开，展示相同的分析管线
7
FlyPredictome 的同源详情页面也可跳转到 LIVIA 同源相互作用组
教程步骤
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