相互作用分析摘要
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| 等级 | 基因 1 | 基因 2 | iLIS | iLIA | iLISA | ipTM | LIR (A/B) | cLIR (A/B) | 长度 (A/B) |
|---|
iLIS:
≥0.551 (1% FPR)
≥0.339 (5% FPR)
≥0.223 (10% FPR)
<0.223 (低于阈值)
iLIS（平均）：
≥0.303 (1% FPR)
≥0.120 (5% FPR)
≥0.073 (10% FPR)
<0.073 (低于阈值)
阈值基于酵母、果蝇和人源大规模Y2H参考数据集（通过ColabFold预测）。iLIS基准详情见Kim et al., 2026。Rank 1（由ipTM决定）可能不是iLIS最高的。
可视化脚本
填充间隙 ≤
个残基
|
最小片段 ≥
个残基
间隙填充可桥接短断裂以显示连续卡通。最小片段可移除短于阈值的孤立LIR片段。
链 A（蛋白 1）
LIR — 可信结构域 (PAE ≤ 12)
#80CBC4
cLIR — 可信界面 (PAE ≤ 12 & Cβ ≤ 8 Å)
#00897B
链 B（蛋白 2）
LIR — 可信结构域 (PAE ≤ 12)
#FFAB91
cLIR — 可信界面 (PAE ≤ 12 & Cβ ≤ 8 Å)
#E64A19
Teal / Coral
Blue / Orange
Purple / Gold
Slate / Rose
Indigo / Tangerine
Green / Red
Cyan / Navy / Peach / Crimson
Sky / Indigo / Salmon / Red
Lime / Forest / Gold / Maroon
Mint / DarkTeal / Apricot / Burnt
Orchid / Purple / Yellow / Fire
Blue / Navy / Sage / Ember
Teal / Coral
Blue / Orange
Purple / Gold
Slate / Rose
Steel / Wheat
Cornflower / Tomato
SkyBlue / Gold
LightGreen / Plum
Salmon / Teal
pLDDT
bychain
bypolymer
下载结构文件（.pdb）和脚本，将两者放在同一文件夹中。双击脚本即可自动启动查看器。
使用方法 (完整指南)
快速开始
- 前往 FlyPredictome 同源搜索 并搜索人源基因
- 点击预测相互作用对以打开详情页
- 复制详情页URL并粘贴到上方
- 下载脚本（.cxc 或 .pml）和结构文件，将两者放在同一文件夹中
- 在 ChimeraX（
.cxc）或 PyMOL（.pml）中打开脚本
AFM-LIS Metrics (Kim et al. 2024; Kim et al. 2026)
| iLIS | 集成 LIS — √(LIS × cLIS) |
| iLIA | 集成 LIA — √(LIA × cLIA)，界面面积计数的几何平均 |
| iLISA | 集成 LISA — iLIS × iLIA，整体结合强度 |
| LIS | 局部相互作用评分 — 标准化PAE置信度（0–1） |
| cLIS | 接触过滤LIS — 限制于直接接触 |
| LIR | 局部相互作用残基（PAE ≤ 12 Å） |
| cLIR | 接触过滤LIR（PAE ≤ 12 Å & Cβ ≤ 8 Å） |
置信度指标（源自ColabFold）
| ipTM | 界面预测TM评分 — 来自预测模型的全局界面置信度 |
PAE（预测对齐误差）衡量模型对两个残基相对位置的置信度 — 值越低表示置信度越高。