LIVIALocal Interaction VIsualization and Analysis (本地蛋白质相互作用可视化与分析)

分析蛋白质结构预测中的相互作用并生成可视化脚本

预测分析

上传来自 AlphaFold-Multimer, AlphaFold3, ColabFold, Boltz-1/2, Chai-1 或 OpenFold3 的预测文件。计算界面置信度指标 (iLIS, LIS, cLIS),查看交互式 PAE/LIS/cLIS 图谱,并生成可视化脚本。

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支持所有主要的结构预测平台 — 无需安装。
浏览预计算的相互作用组 — FlyPredictome · AlphaFold DB

FlyPredictome

从 FlyPredictome 预测中搜索果蝇蛋白质相互作用 (Kim et al., 2026)。

示例:Akt1–foxo, Dl–N, Dsh–Axn

同源相互作用组

从同源预测中搜索人类激酶-转录因子相互作用 (Kim et al., 2025)。

示例:TP53, CDK2, AKT1, BRAF

AFDB 二聚体

从 AlphaFold 蛋白质结构数据库中获取二聚体预测 (Han et al., 2026)。

示例:Fiber protein 2, pp71

AFDB 单体结构域

分析 AlphaFold 单体预测中的分子内结构域相互作用。

示例:Haspin (Q8TF76), SCN9A (Q15858)

教程

各工具的视觉演练 — 通过示例学习。

关于

指标定义、配色方案和参考文献。

GitHub

源代码、文档和问题追踪。

浏览器:已在 Chrome 和 Safari (macOS/iOS) 上测试。所有分析均在您的浏览器中本地运行 — 数据不会离开您的设备。
注:每个预测平台(AlphaFold3, ColabFold, Boltz, Chai-1 等)可能会产生不同的置信度校准。iLIS ≥ 0.223 阈值是使用 ColabFold/AlphaFold-Multimer 预测建立的。其他平台可能需要调整阈值。